More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0874 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  88.32 
 
 		 442 aa  786    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  71.6 
 
 		 425 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  98.83 
 
 		 429 aa  879    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  100 
 
 		 429 aa  889    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  62.82 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  63.18 
 
 		 424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  62.03 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  61.88 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  62.08 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  61.1 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  62.62 
 
 		 434 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  61.65 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  61.72 
 
 		 436 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  61.18 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  60.7 
 
 		 429 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  60.71 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  60.71 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  61.18 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  61.03 
 
 		 454 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  61.18 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  60.29 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  61.41 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  61.86 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  59.24 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  60.05 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  61.86 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  60.05 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  60.1 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  59.76 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  61.18 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  61.37 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  60.14 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  60.38 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  59.3 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  60.62 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  59.39 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  60.57 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  63.1 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  59.62 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  60.14 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  58.77 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  59.38 
 
 		 433 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  60.48 
 
 		 439 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  58.77 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  59.76 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  59.67 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  58.82 
 
 		 438 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  60.86 
 
 		 429 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  58.53 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  59.86 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  60.1 
 
 		 423 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  61.35 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  59.9 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  60.19 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  59.95 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  58 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  59.38 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  59.9 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  58.12 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  59.62 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  60.19 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  61.12 
 
 		 432 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  59.05 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  59.95 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  59.76 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  62.32 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  57.01 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  61.03 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  59.95 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  58.25 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  58.92 
 
 		 432 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  58.29 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  60.19 
 
 		 433 aa  531  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  58.49 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  57.28 
 
 		 426 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  57.72 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  60.47 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  60.24 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  60.47 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  60.24 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  57.86 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  58.16 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  58.25 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  61.59 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  60.68 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  57.51 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  58.78 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  57.88 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  57.51 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  60.19 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  57.51 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>