196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0868 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  58.72 
 
 		 1190 aa  934    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  100 
 
 		 1390 aa  2695    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  92.99 
 
 		 2504 aa  1953    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  52.21 
 
 		 1440 aa  1225    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  42.79 
 
 		 716 aa  258  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  42.54 
 
 		 716 aa  254  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  46.25 
 
 		 876 aa  249  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  46.49 
 
 		 880 aa  248  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  38.77 
 
 		 878 aa  245  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  40.99 
 
 		 1326 aa  198  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  35 
 
 		 1259 aa  197  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  28.67 
 
 		 1674 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  28.2 
 
 		 2157 aa  182  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  44.3 
 
 		 597 aa  178  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  43.88 
 
 		 597 aa  175  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  43.88 
 
 		 597 aa  175  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  47.15 
 
 		 472 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  32.59 
 
 		 1447 aa  173  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  32.59 
 
 		 1447 aa  174  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  32.38 
 
 		 1472 aa  173  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  32.59 
 
 		 1342 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  31.98 
 
 		 1446 aa  170  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.41 
 
 		 1117 aa  169  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  38.6 
 
 		 831 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  41.03 
 
 		 877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 816 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 820 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 816 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 816 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  38.39 
 
 		 816 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  37.43 
 
 		 1713 aa  165  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.76 
 
 		 1549 aa  164  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  31.97 
 
 		 1616 aa  163  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.71 
 
 		 1616 aa  162  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1616 aa  162  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  31.76 
 
 		 1588 aa  160  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  38.06 
 
 		 740 aa  155  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  41.01 
 
 		 330 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  43.25 
 
 		 810 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  38.02 
 
 		 766 aa  149  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  42.39 
 
 		 1197 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  42.39 
 
 		 1197 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  42.39 
 
 		 1197 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  48.31 
 
 		 423 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  30.32 
 
 		 2095 aa  142  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  45.71 
 
 		 536 aa  141  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  48.26 
 
 		 575 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  50.3 
 
 		 1451 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  46.03 
 
 		 356 aa  139  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  34.68 
 
 		 1204 aa  138  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  49.1 
 
 		 1125 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  40.65 
 
 		 4384 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  45.2 
 
 		 589 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.49 
 
 		 655 aa  127  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  34.59 
 
 		 279 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  40.72 
 
 		 3126 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  37.12 
 
 		 1309 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.12 
 
 		 1854 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  32.03 
 
 		 1471 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  32.03 
 
 		 1471 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  51.82 
 
 		 2396 aa  117  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  44.71 
 
 		 1417 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  32.47 
 
 		 1353 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  38.82 
 
 		 2832 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  30.47 
 
 		 1434 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.22 
 
 		 1072 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  33.08 
 
 		 492 aa  110  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  34.33 
 
 		 3192 aa  110  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  42.86 
 
 		 967 aa  108  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  36.29 
 
 		 735 aa  105  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  33.93 
 
 		 2141 aa  105  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 1122 aa  103  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  31.99 
 
 		 1122 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  31.99 
 
 		 1122 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 1090 aa  103  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 1090 aa  103  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  32.23 
 
 		 1090 aa  103  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  31.35 
 
 		 1074 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  32.57 
 
 		 2868 aa  101  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  29.5 
 
 		 4191 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  28.61 
 
 		 1916 aa  100  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  33.67 
 
 		 548 aa  100  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.08 
 
 		 4726 aa  100  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  38.46 
 
 		 1516 aa  98.2  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  48.68 
 
 		 898 aa  97.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  39.33 
 
 		 373 aa  96.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  39.33 
 
 		 373 aa  96.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  39.33 
 
 		 378 aa  96.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  39.33 
 
 		 192 aa  95.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  39.33 
 
 		 192 aa  95.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  28.39 
 
 		 3635 aa  95.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  28.25 
 
 		 963 aa  95.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  39.43 
 
 		 990 aa  94.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  40.45 
 
 		 1012 aa  94  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  40.45 
 
 		 1068 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  36.93 
 
 		 378 aa  94.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  40.45 
 
 		 962 aa  94  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  36.93 
 
 		 460 aa  93.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>