88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0862 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  100 
 
 		 281 aa  557  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  97.15 
 
 		 281 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  62.81 
 
 		 283 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  52.98 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  36.36 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  40.62 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1517  putative general secretion pathway protein K  33.6 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1757  putative general secretion pathway protein K  31.2 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  25.87 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  27.78 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  25.24 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  28.44 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0916  putative general secretion pathway protein K  28.64 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  27.1 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2617  putative general secretion pathway protein K  29.25 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  30.67 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1613  putative general secretion pathway protein K  33.33 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1284  putative general secretion pathway protein K, GspK  30.94 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  42.17 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2177  general secretion pathway protein GspK  27.9 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  28.82 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  42.17 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3311  general secretion pathway protein K, putative  27.95 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3145  general secretion pathway protein K, putative  27.17 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.132735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  24.19 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  39 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  25.32 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2113  putative general secretion pathway protein K  30.89 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  37.37 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2099  hypothetical protein  28.02 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165009  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  39.76 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  28.12 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  37 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  38 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3661  Type II secretory pathway component PulK-like  29.35 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  38 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  26.79 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0033  putative general secretion pathway protein K  33.16 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  25.09 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  37 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  35.64 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  30.77 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  37 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2770  hypothetical protein  31.9 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.906169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  26.61 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  39.29 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  31.25 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  40.24 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3639  Type II secretory pathway component PulK-like protein  36.19 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  40.24 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  40.24 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  40.24 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  40.24 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.15 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  32.41 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  32.06 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  22.45 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  21.86 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  27.75 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1607  hypothetical protein  29.89 
 
 		 404 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  30.43 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4154  general secretory pathway protein K  27.36 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177743  hitchhiker  0.0000571995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  25.23 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  27.75 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  24.53 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  40.3 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  24.32 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0884  hypothetical protein  28.02 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  27.67 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  28.43 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  26.63 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  28.36 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  23.33 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0682  general secretory pathway protein K  28.57 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.0114744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  23.87 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  23.87 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  23.87 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  23.23 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1786  putative general secretion pathway protein K  26.26 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  23.23 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.44 
 
 		 361 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  23.81 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>