289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0811 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  100 
 
 		 284 aa  591  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  99.65 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  73.33 
 
 		 285 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  50.36 
 
 		 276 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  50.36 
 
 		 276 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 		 276 aa  248  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  39.85 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  39.85 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  39.85 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  38.75 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  39.11 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  39.78 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  39.78 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  39.78 
 
 		 273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  39.43 
 
 		 273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  31.37 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  31 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  29.93 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  39.77 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  26.38 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 383 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  24.13 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  24.01 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.27 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1015 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  35.29 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.6 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  35.29 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  34.36 
 
 		 366 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  26.55 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 1001 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.34 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.34 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  27.97 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  44.87 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 645 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  25.9 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  23.38 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 627 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  22.97 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  25.49 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  25.49 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.6 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.62 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.01 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 		 673 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.5 
 
 		 401 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  21.34 
 
 		 336 aa  72  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  25.6 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.2 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.2 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  24.27 
 
 		 659 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.24 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  24.4 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 659 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 660 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  26.22 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  26.22 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>