157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0779 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  98.6 
 
 
215 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  58.38 
 
 
216 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  57.07 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  46.6 
 
 
275 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  41.58 
 
 
260 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  41.58 
 
 
260 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  40.84 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.9 
 
 
214 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.41 
 
 
211 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  37.57 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.93 
 
 
211 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
210 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 
211 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 
216 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.52 
 
 
214 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 
213 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
212 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
206 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
215 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  33.69 
 
 
212 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.17 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
212 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
213 aa  104  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 
206 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
211 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
220 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 
213 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  34 
 
 
225 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.35 
 
 
212 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 
212 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.27 
 
 
212 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 
218 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.55 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  29.57 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
233 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  32.11 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  31.43 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
220 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  31.33 
 
 
293 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
216 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
216 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
216 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.38 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  24.76 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  24.29 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.18 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.12 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1088  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  28.05 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.456825  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.32 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.77 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>