84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0598 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  100 
 
 		 628 aa  1258    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  72.91 
 
 		 572 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  87.48 
 
 		 639 aa  1029    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  69.02 
 
 		 548 aa  671    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.38 
 
 		 655 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  54.14 
 
 		 623 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.95 
 
 		 646 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  51.28 
 
 		 1209 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.15 
 
 		 767 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.8 
 
 		 1128 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.59 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  45.71 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  46.53 
 
 		 743 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.14 
 
 		 452 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  43.72 
 
 		 791 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  45.6 
 
 		 596 aa  365  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.32 
 
 		 588 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.55 
 
 		 590 aa  361  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  44.14 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  43.47 
 
 		 589 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  44.2 
 
 		 605 aa  352  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  34.35 
 
 		 393 aa  203  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  33.89 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  63.64 
 
 		 614 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  53.33 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  25.52 
 
 		 393 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  25.68 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  23.94 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  26.39 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  26.54 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  42.5 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  39.53 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  24.44 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  24.07 
 
 		 380 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  25.13 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  25.2 
 
 		 341 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  23.64 
 
 		 870 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  27.64 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  27.1 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  27.1 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  27.1 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  23.89 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  39.33 
 
 		 1186 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  23.6 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  24.92 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.87 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  32.91 
 
 		 811 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  23.58 
 
 		 434 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  23.84 
 
 		 359 aa  55.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  23.7 
 
 		 465 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  38.57 
 
 		 990 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  24.14 
 
 		 487 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  38.2 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  26.62 
 
 		 448 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30195  hypothetical protein, likely cell wall localized and GPI-anchored mucin like  43.4 
 
 		 812 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.32 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  38.55 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  41.43 
 
 		 598 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  25 
 
 		 456 aa  50.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  41.89 
 
 		 597 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.35 
 
 		 1298 aa  48.9  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  41.33 
 
 		 775 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  23.84 
 
 		 446 aa  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 		 966 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  36.05 
 
 		 854 aa  47.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.67 
 
 		 998 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  37.14 
 
 		 690 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  35.44 
 
 		 938 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.46 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42.11 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 		 963 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  28.4 
 
 		 1055 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  37.84 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  36.36 
 
 		 371 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 562 aa  44.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  27.08 
 
 		 3151 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  30.56 
 
 		 699 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 		 1137 aa  44.3  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 846 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  36 
 
 		 787 aa  43.9  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  37.97 
 
 		 436 aa  43.9  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 495 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>