More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0206 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0206  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 86 aa  173  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0182  30S ribosomal protein S15  98.84 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  89.53 
 
 		 86 aa  157  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  88.37 
 
 		 86 aa  153  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  70.37 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  70.89 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  70.89 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  70.89 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  65.48 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  70.89 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  67.5 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  67.9 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  68.35 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  67.9 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  64.29 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  67.5 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  61.45 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  68.35 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1419  30S ribosomal protein S15  68.35 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22503  normal  0.956384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  67.5 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  67.09 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  64.29 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  66.25 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  65.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  64.2 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  65.82 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  65.43 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.2 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  63.75 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  64.56 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  65.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  61.73 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  64.56 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  64.56 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  64.56 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>