71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0151 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  98.05 
 
 
257 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  58.89 
 
 
263 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2643  17 kDa surface antigen  52.26 
 
 
280 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.796605  normal  0.311018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  36.3 
 
 
175 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  35.97 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  35.97 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  35.97 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60311e-08 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  35.97 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.89224e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  34.25 
 
 
179 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3622e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.5989e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  35.62 
 
 
178 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  34.93 
 
 
179 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  39.57 
 
 
182 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  40.29 
 
 
182 aa  80.1  3e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  39.04 
 
 
182 aa  80.5  3e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  40.29 
 
 
176 aa  79.3  5e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  40.29 
 
 
177 aa  78.6  9e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  4.05508e-08 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  39.57 
 
 
176 aa  78.2  1e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  39.86 
 
 
178 aa  78.6  1e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  37.67 
 
 
180 aa  78.2  1e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  38.85 
 
 
179 aa  77.8  2e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  39.86 
 
 
180 aa  76.6  4e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  38.13 
 
 
179 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  37.41 
 
 
179 aa  73.9  2e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  36.6 
 
 
179 aa  73.2  4e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  34.31 
 
 
177 aa  72.4  6e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  36.24 
 
 
179 aa  70.9  2e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  37.08 
 
 
181 aa  68.2  1e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  35.57 
 
 
179 aa  67  3e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  32.69 
 
 
179 aa  65.1  1e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  32.69 
 
 
179 aa  65.1  1e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  32.05 
 
 
179 aa  63.2  4e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  33.65 
 
 
206 aa  58.2  1e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  33.65 
 
 
204 aa  58.2  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  33.65 
 
 
216 aa  55.1  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
215 aa  54.7  2e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
215 aa  54.7  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
216 aa  54.3  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  32.08 
 
 
217 aa  52.4  7e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  30.73 
 
 
172 aa  52  8e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  32.69 
 
 
272 aa  52  9e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  27.32 
 
 
175 aa  51.6  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  31.73 
 
 
208 aa  50.1  3e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  30.86 
 
 
172 aa  49.7  5e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  33.7 
 
 
225 aa  48.5  9e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  48.89 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  48.89 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  48.89 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  48.89 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  48.89 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  48.89 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  48.89 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  47.37 
 
 
120 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  40.54 
 
 
146 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  29.33 
 
 
158 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  1.08744e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  51.22 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  51.22 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  36.14 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.76746e-05  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  29.82 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.6604e-05  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  26.43 
 
 
171 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  35.96 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.41658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  55.81 
 
 
126 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 
158 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>