50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0133 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  100 
 
 		 271 aa  568  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  99.26 
 
 		 271 aa  564  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  63.3 
 
 		 268 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  60.61 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  50.58 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  50.19 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  33.99 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  35.12 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  32.53 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  32.78 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  33.81 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  31.99 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  30.43 
 
 		 395 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  29.06 
 
 		 934 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  29.6 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  30.43 
 
 		 477 aa  89  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  29.58 
 
 		 789 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  27.27 
 
 		 820 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  26.62 
 
 		 640 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  27.8 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  26.91 
 
 		 688 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  27.56 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  25.63 
 
 		 535 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  26.03 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  26.64 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  46.67 
 
 		 814 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  30.6 
 
 		 619 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  24.75 
 
 		 753 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  33.9 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  24.06 
 
 		 652 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  24.81 
 
 		 652 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  26.22 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  36.99 
 
 		 354 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  26.01 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  23.46 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  24.32 
 
 		 1066 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  23.16 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  23.16 
 
 		 353 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  20.78 
 
 		 599 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  27.44 
 
 		 812 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  38.71 
 
 		 571 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.43 
 
 		 1628 aa  45.4  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  24.06 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  22.78 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.79 
 
 		 1332 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  27.38 
 
 		 698 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.22 
 
 		 1242 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  25.22 
 
 		 697 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  50 
 
 		 1202 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>