More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0101 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 
876 aa  979  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  1.32365e-06 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
874 aa  980  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1437  alanyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
874 aa  931  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.738644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
875 aa  888  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79189e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
884 aa  1814  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
886 aa  763  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
874 aa  983  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
874 aa  971  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
892 aa  775  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
897 aa  918  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
876 aa  986  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
863 aa  681  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
876 aa  985  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
875 aa  935  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
880 aa  692  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
883 aa  843  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
897 aa  919  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  98.53 
 
 
884 aa  1788  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
901 aa  782  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 
876 aa  979  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  3.67228e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  76.36 
 
 
882 aa  1309  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
888 aa  696  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
885 aa  690  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
889 aa  783  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
886 aa  676  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
876 aa  803  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
888 aa  698  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
876 aa  723  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
891 aa  780  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
878 aa  696  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  75.57 
 
 
882 aa  1348  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  57.03 
 
 
888 aa  991  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
874 aa  980  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
876 aa  988  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
874 aa  981  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
877 aa  674  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
880 aa  654  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
905 aa  712  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  6.4855e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
865 aa  876  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4081  alanyl-tRNA synthetase  50 
 
 
884 aa  761  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
913 aa  837  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0686  alanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
852 aa  687  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00144447  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0986  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
845 aa  646  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
875 aa  937  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1429  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
842 aa  671  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
904 aa  748  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
880 aa  671  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
885 aa  801  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 
874 aa  980  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
874 aa  955  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
872 aa  924  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  4.64441e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
887 aa  803  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
876 aa  684  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
865 aa  925  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
876 aa  986  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
891 aa  769  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
875 aa  934  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0723e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
865 aa  874  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.18492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
874 aa  984  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
876 aa  676  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 
874 aa  988  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
879 aa  669  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
874 aa  979  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
889 aa  687  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
887 aa  813  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  2.32232e-10 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
876 aa  756  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
875 aa  978  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
892 aa  966  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
874 aa  981  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0051  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
852 aa  665  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
876 aa  987  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
859 aa  651  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
880 aa  645  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
879 aa  743  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
889 aa  648  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
879 aa  661  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 
871 aa  651  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
854 aa  654  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
886 aa  661  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
875 aa  756  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 
875 aa  946  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
875 aa  944  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  56.58 
 
 
876 aa  987  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0998  alanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
875 aa  915  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.932608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 
893 aa  996  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
884 aa  796  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
877 aa  673  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3176  alanyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
874 aa  958  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
874 aa  956  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
881 aa  699  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
878 aa  672  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
869 aa  944  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
876 aa  679  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
879 aa  699  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
882 aa  638  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
870 aa  647  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1667  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
846 aa  658  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0503075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
953 aa  665  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
860 aa  938  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
890 aa  756  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>