122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0060 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  100 
 
 		 354 aa  713    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  92.37 
 
 		 354 aa  659    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  60.17 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  46.01 
 
 		 345 aa  271  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  34.42 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  35.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  36.12 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  35.4 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  37.38 
 
 		 204 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  26.65 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  27.7 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  30.04 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  29.39 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  29.08 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  32.7 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  28.72 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0147  hypothetical protein  25.96 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1618  hypothetical protein  25.96 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0169  hypothetical protein  25.96 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4005  hypothetical protein  28.26 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  28.14 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  28.06 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.93 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  33.12 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.45 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  27.33 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.45 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.45 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.45 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.94 
 
 		 165 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  25.24 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.88 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  31.45 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  31.45 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  33.33 
 
 		 175 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  31.45 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.92 
 
 		 190 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  31.41 
 
 		 176 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.77 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.94 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  30.77 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.94 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.94 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  30.77 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.94 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.92 
 
 		 190 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  30.77 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3015  fimbrial protein  26.07 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.92 
 
 		 190 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.82 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6686  fimbrial protein  27.18 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.21 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.21 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.21 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0133  fimbrial protein subfamily protein  26.21 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.21 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.94 
 
 		 165 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  28.67 
 
 		 190 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  28.67 
 
 		 190 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.3 
 
 		 165 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  27.96 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  28.67 
 
 		 187 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.63 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.63 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.63 
 
 		 170 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  26.34 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.5 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  30.82 
 
 		 184 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.54 
 
 		 176 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  35.53 
 
 		 174 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  41.11 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  26.85 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  27.5 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  29 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.87 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  31.54 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  41.11 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.67 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  40 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  31.58 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  27.27 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  40 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  40 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  40 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  40 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  40 
 
 		 170 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  27.27 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  30.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  40 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  31.65 
 
 		 174 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.57 
 
 		 175 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  23.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  23.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  26.92 
 
 		 387 aa  46.2  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  26.9 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.91 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>