More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0047 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  100 
 
 		 359 aa  733    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  99.42 
 
 		 344 aa  701    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  37.16 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  29.52 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  30.32 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  31.22 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  31.22 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  29.09 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  35.9 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  27.6 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  31.21 
 
 		 668 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1601  parB-like partition protein  32.73 
 
 		 864 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.17 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  32.05 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  36.94 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  32.86 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  36.64 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4223  parB-like partition proteins  36.75 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  28.14 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  32.06 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  33.09 
 
 		 293 aa  67  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  37.19 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  37.19 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  30.53 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.32 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  33.61 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  34.71 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  39.45 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  39.45 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  35.09 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  30.2 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  34.56 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  32.67 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.46 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  36 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  25.24 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  31.47 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  34.56 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  30.36 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  39.56 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  30.95 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  37.25 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  30.95 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  32.28 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  26.04 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  29.34 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  31.43 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  26.6 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  25.67 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  32.77 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  36.54 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  36.54 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  36.54 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  34.45 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  34.45 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  34.45 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  38.46 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  38.46 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  38.46 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  36.61 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  35.96 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  39.08 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  32.76 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  29.2 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  29.2 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  32.39 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.71 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2980  ParB-like chromosome partitioning protein  27.6 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  28.47 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  34.4 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  24.46 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  40.66 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  36.78 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1727  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  35.56 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  28.8 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  29.19 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  30.51 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  33.88 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  33.62 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  32.77 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  38.54 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  32.19 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  30.25 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  32.12 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.71 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>