155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0037 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  98.29 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  65.89 
 
 
302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  64.85 
 
 
285 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  42.41 
 
 
287 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  40.48 
 
 
278 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  40.48 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  36.86 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  41.02 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  36.55 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  37.54 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  36.52 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  38.41 
 
 
278 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0458  hypothetical protein  39.1 
 
 
279 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0983546  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  38.41 
 
 
278 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2382  hypothetical protein  39.54 
 
 
297 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0256369  normal  0.814662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  34.48 
 
 
280 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  36.86 
 
 
279 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  36.73 
 
 
280 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  36.73 
 
 
280 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  36.73 
 
 
280 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  36.73 
 
 
280 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  36.73 
 
 
280 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  40.59 
 
 
312 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  43.27 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  37.58 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  38.75 
 
 
278 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  40.48 
 
 
300 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  38.97 
 
 
278 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0490056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0569  hypothetical protein  42.56 
 
 
282 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000849382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  39.5 
 
 
286 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  35.71 
 
 
280 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  35.49 
 
 
280 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  35.71 
 
 
280 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  35.37 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  36.91 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  35.37 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  35.37 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  35.37 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  35.37 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  39.79 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  35.37 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  35.37 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0644  hypothetical protein  36.67 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103865  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  34.36 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  35.37 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  35.37 
 
 
280 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0404  hypothetical protein  37.37 
 
 
278 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  34.69 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  34.69 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4772  hypothetical protein  36.68 
 
 
278 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  34.69 
 
 
280 aa  178  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  39.1 
 
 
281 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  35.03 
 
 
280 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4187  hypothetical protein  34.47 
 
 
280 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1863  hypothetical protein  39.79 
 
 
279 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302117  normal  0.857152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  38.62 
 
 
285 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0563  hypothetical protein  33.55 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0551  hypothetical protein  33.55 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  39.19 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4472  protein of unknown function DUF519  34.13 
 
 
280 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  37.07 
 
 
289 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  37.41 
 
 
290 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  37.8 
 
 
289 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  37.59 
 
 
285 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3149  hypothetical protein  39.12 
 
 
285 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5822  protein of unknown function DUF519  41.52 
 
 
282 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  36.21 
 
 
281 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5263  hypothetical protein  39.58 
 
 
282 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01957  hypothetical protein  35.06 
 
 
292 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00454208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1413  hypothetical protein  35.57 
 
 
289 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  38 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  38.05 
 
 
285 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1668  protein of unknown function DUF519  37.76 
 
 
281 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  37.85 
 
 
284 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  32.87 
 
 
282 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  32.31 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  36.9 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  35.93 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  35.79 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  38.72 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  37.59 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  36.24 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2267  hypothetical protein  38.71 
 
 
282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28225  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  32.75 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  31.31 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  36.73 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  37.12 
 
 
286 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  30.9 
 
 
281 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  30.9 
 
 
281 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  32.29 
 
 
292 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  38.11 
 
 
282 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  31.6 
 
 
284 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  32.3 
 
 
284 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5542  hypothetical protein  37.93 
 
 
281 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  37.54 
 
 
281 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  38.03 
 
 
281 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  30.56 
 
 
281 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  35.17 
 
 
281 aa  158  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0747  hypothetical protein  33.9 
 
 
311 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.141291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>