103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0023 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  100 
 
 		 167 aa  335  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  98.8 
 
 		 191 aa  333  9e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  37.41 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  34.52 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  31.58 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  32.16 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  45.95 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  30.28 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  36.31 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.49 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  40.62 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.27 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  45.21 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  43.42 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  43.42 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.3 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.58 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.18 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  43.42 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.52 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  46.67 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  45 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.52 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  45.31 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  45 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  33.64 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  34.31 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  31.09 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  26.86 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  50 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  46.3 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.09 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.46 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  46.03 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  46.03 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  42.86 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  40 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  29.3 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.06 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.16 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.06 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.74 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.06 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.42 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.45 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  32.23 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.06 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  31.97 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.43 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  31.93 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.8 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.03 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  28.49 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.06 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.94 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  31.93 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  25.21 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  29.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  44.44 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.78 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  41.79 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.04 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  29.66 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.74 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  31.1 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  29.82 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  29.82 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  26.99 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.54 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  26.71 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.27 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  26.11 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.98 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.3 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.71 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.21 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  53.19 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  30 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  30.26 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  37.33 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.35 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  46.81 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5189  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  40.62 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  25 
 
 		 171 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  24.2 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  23.49 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  40 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  25.22 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  33.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.77 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.1 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  37.04 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0963  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.7 
 
 		 169 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  22.29 
 
 		 175 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  40.32 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.35 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>