More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0012 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0012  biopolymer transport ExbD2 protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0012  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.511922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0011  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  82.09 
 
 
137 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03473  biopolymer transport ExbD2 protein  83.2 
 
 
126 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3412  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.55 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.544248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
143 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
143 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  43.28 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.2 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.97 
 
 
176 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.16 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.16 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.16 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.16 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 
136 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  41.61 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 
141 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
153 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.82 
 
 
141 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.82 
 
 
141 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 
136 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
151 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 
136 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 
136 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 
137 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
138 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  44.35 
 
 
172 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
151 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.94 
 
 
176 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
151 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.42 
 
 
151 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 
139 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 
140 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.35 
 
 
178 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.1 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.59 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.59 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.59 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.59 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.59 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.59 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  37.59 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 
137 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  35.61 
 
 
139 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.84 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0120  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.96 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0436048  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  39.02 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 
137 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.04 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.74 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
137 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
156 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  35.61 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0805  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  35.11 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.21 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 
142 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2090  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 
144 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0249583  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  36.03 
 
 
143 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  38.28 
 
 
139 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1936  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
142 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0014  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  37.5 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  35.25 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.56 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.29 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  40 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>