More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2239 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  93.59 
 
 
154 aa  276  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  66.48 
 
 
186 aa  246  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  63.93 
 
 
191 aa  240  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  64.25 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  63.13 
 
 
185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  60.22 
 
 
185 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  56.28 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  54.1 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  54.1 
 
 
190 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  54.95 
 
 
205 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  54.95 
 
 
205 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  51.91 
 
 
185 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  50.54 
 
 
205 aa  185  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  51.98 
 
 
186 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  50.27 
 
 
184 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  48.9 
 
 
180 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  46.99 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.53 
 
 
188 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  45.3 
 
 
198 aa  141  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  43.55 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  44.81 
 
 
183 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  42.25 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 
187 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  39.67 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
185 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  45.11 
 
 
184 aa  131  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  42.31 
 
 
185 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  45.65 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.13 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  41.4 
 
 
185 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  43.58 
 
 
198 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.66 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.11 
 
 
185 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 
199 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.01 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  37.57 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
201 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  45.36 
 
 
184 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.85 
 
 
182 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.67 
 
 
185 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.67 
 
 
185 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.38 
 
 
188 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 
196 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
181 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.66 
 
 
191 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
191 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 
191 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
209 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  37.7 
 
 
196 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  47.62 
 
 
195 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 
192 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 
201 aa  121  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
185 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 
188 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 
196 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  41.94 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  40.64 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  40.64 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
196 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  34.92 
 
 
189 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  35.91 
 
 
181 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  38.1 
 
 
193 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.96 
 
 
186 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  35.75 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  37.77 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 
201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  36.26 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
313 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36.7 
 
 
228 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  38.42 
 
 
190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  38.42 
 
 
190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  38.42 
 
 
190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  36.81 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  40.86 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  38.67 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  37.91 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  40.66 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 
290 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>