30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2188 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  808    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  93.33 
 
 		 405 aa  759    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  49.87 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  51.28 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  51.65 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  48.98 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  50.76 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  50.13 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  48.96 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  48.22 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  51.51 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  46.79 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  47.38 
 
 		 395 aa  345  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  48.34 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  33.16 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  33.93 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  37.5 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  31.08 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  30.83 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  47.79 
 
 		 145 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  30.65 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  32.82 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  27.18 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  28.69 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  25.9 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  25.95 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  28.46 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  46.43 
 
 		 101 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  45.59 
 
 		 92 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>