36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2185 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1024    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  96.35 
 
 
494 aa  950    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  64.01 
 
 
484 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  60.94 
 
 
484 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  57.46 
 
 
481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  57.06 
 
 
482 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  55.17 
 
 
482 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  57.06 
 
 
480 aa  535  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  55.89 
 
 
488 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  55.83 
 
 
482 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  56.1 
 
 
483 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  55.42 
 
 
481 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  48.88 
 
 
478 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  47.18 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  47.03 
 
 
486 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  57.23 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  47.26 
 
 
489 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  32.11 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  31 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  29.32 
 
 
487 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  43.75 
 
 
176 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  25.76 
 
 
488 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  28.48 
 
 
515 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.61 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  28.49 
 
 
538 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  27.84 
 
 
499 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.28 
 
 
487 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  28.15 
 
 
450 aa  93.2  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  24.62 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  25 
 
 
485 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  24.62 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  23.87 
 
 
482 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  24.09 
 
 
507 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  21.13 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  24.27 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  23.19 
 
 
499 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>