More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2125 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2214  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  99.03 
 
 		 724 aa  1432    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  68.23 
 
 		 712 aa  981    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2125  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  100 
 
 		 748 aa  1493    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.842151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  70.95 
 
 		 711 aa  1025    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.64 
 
 		 725 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.99 
 
 		 713 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.32 
 
 		 725 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.66 
 
 		 730 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.53 
 
 		 730 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.53 
 
 		 730 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.27 
 
 		 730 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  43.62 
 
 		 762 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.49 
 
 		 750 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.28 
 
 		 756 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.64 
 
 		 738 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.99 
 
 		 738 aa  557  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.46 
 
 		 712 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.33 
 
 		 709 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.46 
 
 		 711 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.21 
 
 		 702 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.15 
 
 		 709 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.15 
 
 		 709 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.43 
 
 		 711 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.97 
 
 		 713 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.97 
 
 		 713 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.97 
 
 		 713 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.92 
 
 		 712 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.6 
 
 		 708 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  41.01 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.72 
 
 		 702 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.39 
 
 		 702 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.39 
 
 		 702 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.39 
 
 		 702 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.61 
 
 		 702 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.39 
 
 		 702 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.47 
 
 		 702 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.39 
 
 		 702 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.47 
 
 		 702 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.88 
 
 		 705 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  42.2 
 
 		 702 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  42.33 
 
 		 702 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.25 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.15 
 
 		 709 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.33 
 
 		 702 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.66 
 
 		 725 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.33 
 
 		 702 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  42.2 
 
 		 702 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.24 
 
 		 734 aa  528  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.25 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.25 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.37 
 
 		 707 aa  525  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.42 
 
 		 706 aa  525  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.15 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.86 
 
 		 708 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.38 
 
 		 707 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.52 
 
 		 707 aa  522  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.94 
 
 		 749 aa  519  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.37 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1344  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.76 
 
 		 732 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.37 
 
 		 705 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.81 
 
 		 718 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.01 
 
 		 707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.23 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.97 
 
 		 718 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.33 
 
 		 715 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.57 
 
 		 722 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.18 
 
 		 721 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.37 
 
 		 711 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.32 
 
 		 701 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.39 
 
 		 752 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.98 
 
 		 711 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.65 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.18 
 
 		 699 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  42.3 
 
 		 734 aa  462  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.56 
 
 		 768 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.52 
 
 		 776 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.54 
 
 		 807 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0981  putative RNA methylase  35.88 
 
 		 751 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1014  THUMP domain protein  34.06 
 
 		 760 aa  348  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.520443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  53.99 
 
 		 343 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  33.86 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1312  THUMP domain protein  45.96 
 
 		 768 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530559  normal  0.0438625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  38.58 
 
 		 376 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  38.58 
 
 		 376 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5734  oxidoreductase  44.82 
 
 		 365 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  38.83 
 
 		 393 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  43.52 
 
 		 657 aa  231  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  38.6 
 
 		 389 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  38.52 
 
 		 391 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  36.73 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 315 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  37.31 
 
 		 393 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24665  hypothetical protein  48.16 
 
 		 367 aa  218  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  41.08 
 
 		 321 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  32.82 
 
 		 374 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  31.89 
 
 		 375 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  31.89 
 
 		 375 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  34.18 
 
 		 385 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  29.44 
 
 		 387 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>