More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2002 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 619 aa  1245    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  99.03 
 
 		 621 aa  1197    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  74.05 
 
 		 625 aa  901    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  54.9 
 
 		 611 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  51.27 
 
 		 630 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  53.29 
 
 		 623 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  52.08 
 
 		 629 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  52.34 
 
 		 641 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  52.73 
 
 		 632 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  52.94 
 
 		 632 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  51.58 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  52.94 
 
 		 633 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  52.03 
 
 		 633 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  51.88 
 
 		 633 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  51.58 
 
 		 645 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  51.18 
 
 		 648 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  48.97 
 
 		 641 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  52.59 
 
 		 633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  50.08 
 
 		 611 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  83.04 
 
 		 634 aa  571  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  50.39 
 
 		 652 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  48.99 
 
 		 636 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  48.28 
 
 		 613 aa  551  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  49.84 
 
 		 644 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  49.92 
 
 		 655 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  50.16 
 
 		 636 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  49.37 
 
 		 647 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  49.69 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  46.57 
 
 		 616 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  49.61 
 
 		 635 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  47.94 
 
 		 622 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  47.13 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  49.92 
 
 		 626 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.76 
 
 		 691 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  45.41 
 
 		 630 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  46.59 
 
 		 661 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  46.6 
 
 		 644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  46.28 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  47.3 
 
 		 598 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  46.25 
 
 		 661 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  46.88 
 
 		 660 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  46.58 
 
 		 667 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  46.58 
 
 		 667 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.11 
 
 		 705 aa  512  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  48.97 
 
 		 617 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  45.17 
 
 		 681 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  48.81 
 
 		 620 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  47.33 
 
 		 635 aa  505  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  45.26 
 
 		 574 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  47.52 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 		 684 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  47.68 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  45.18 
 
 		 575 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  45.41 
 
 		 674 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  47.81 
 
 		 604 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  45.2 
 
 		 664 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  44.51 
 
 		 651 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  42.74 
 
 		 626 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 		 606 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  42.4 
 
 		 643 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  42.63 
 
 		 602 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  43.74 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  45.54 
 
 		 612 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.42 
 
 		 628 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.23 
 
 		 616 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  44.03 
 
 		 595 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  44.64 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  43.09 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  44.12 
 
 		 597 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  41.57 
 
 		 600 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  41.17 
 
 		 600 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  43.09 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  42.16 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  43.96 
 
 		 597 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  41.92 
 
 		 605 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  41.17 
 
 		 623 aa  432  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  43.56 
 
 		 603 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  41.17 
 
 		 623 aa  432  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  42.47 
 
 		 599 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42 
 
 		 644 aa  432  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  41.07 
 
 		 617 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  41.98 
 
 		 618 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  43.9 
 
 		 621 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  42.9 
 
 		 603 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  42.83 
 
 		 603 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  42.84 
 
 		 637 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  44.5 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  41.84 
 
 		 610 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  42.2 
 
 		 603 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  42.32 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  40.67 
 
 		 606 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  42.05 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  43.36 
 
 		 648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  41.88 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  40.16 
 
 		 622 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  41.05 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>