More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1867 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  99.48 
 
 		 381 aa  755    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 381 aa  759    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  64.52 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  53.35 
 
 		 375 aa  346  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  46.3 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  47.01 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  47.16 
 
 		 377 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  46.2 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  48.74 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  44.35 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  45.29 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  46.31 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.55 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  43.22 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  45.95 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  43.22 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  43.85 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  41.76 
 
 		 372 aa  249  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  43.82 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.61 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.97 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  44.51 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.15 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  43.71 
 
 		 338 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  43.71 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  43.71 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.83 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  41.31 
 
 		 399 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 365 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  44 
 
 		 338 aa  235  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.81 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  48.74 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  39.47 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.21 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  45.13 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.87 
 
 		 361 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  42.3 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 338 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.56 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  40.52 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  41.97 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  40.87 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.87 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  43.18 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  41.74 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  43.65 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  43.37 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  45.87 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  41.29 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 421 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  42.75 
 
 		 339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 475 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  44.84 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  39.64 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  45.28 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  43.64 
 
 		 475 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  41.79 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  42.99 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  45.14 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  39.47 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  37.59 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.64 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  41.77 
 
 		 422 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  42.06 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.92 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  38.19 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  45.34 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  41.64 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  37.87 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  53.67 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  45.02 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  44.69 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>