135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1866 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  98.18 
 
 		 384 aa  776    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 384 aa  790    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  61.07 
 
 		 366 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  58.91 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  30.89 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  32.51 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  30.36 
 
 		 345 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  31.45 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  31.18 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  30.75 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  28.93 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  30.11 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  30.29 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  29.68 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  32.98 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.66 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  28.23 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  31.2 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  28.1 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.69 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  29.51 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.32 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  28.39 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  28.07 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 419 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  27.06 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  27.82 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  27.53 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  27.15 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  30.27 
 
 		 346 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  28.88 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  27.57 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  31.1 
 
 		 417 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  27.63 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  26.72 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  29.19 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  26.87 
 
 		 367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  26.93 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  26.68 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  30.41 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  26.87 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  28.42 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  26.43 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  29.08 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  27.13 
 
 		 345 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  27.62 
 
 		 362 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  27.65 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  26.62 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  24.46 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  29.97 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  28.49 
 
 		 358 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  23.84 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  24.2 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  25.56 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  25.56 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  25.7 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  23.63 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  23.68 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  26.23 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  26.03 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  23.61 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  50.75 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  24.06 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  45.33 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  24.23 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  23.75 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  23.75 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  43.66 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  43.24 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  38.82 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  21.83 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.02 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  38.75 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  48.89 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  48.21 
 
 		 219 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  36.23 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 651 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  36.67 
 
 		 148 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  37.14 
 
 		 203 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 235 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  41.82 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  44 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  42 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  35.96 
 
 		 1225 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  41.67 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  32.5 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  39.58 
 
 		 166 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>