More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1801 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  73.86 
 
 
461 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
461 aa  932    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  97.83 
 
 
461 aa  880    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  68.55 
 
 
461 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  51.66 
 
 
467 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  49.67 
 
 
464 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.55 
 
 
469 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  48.7 
 
 
483 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  50.11 
 
 
461 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  47.82 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.45 
 
 
478 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  48.57 
 
 
461 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  48.57 
 
 
461 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.29 
 
 
473 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.24 
 
 
472 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  41.45 
 
 
461 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.58 
 
 
459 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.28 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  43.02 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  43.26 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.91 
 
 
462 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.17 
 
 
459 aa  349  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  40.53 
 
 
461 aa  348  9e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.31 
 
 
470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 
466 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.31 
 
 
470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.31 
 
 
470 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.31 
 
 
470 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.87 
 
 
470 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
470 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 
470 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.65 
 
 
470 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 
470 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.65 
 
 
470 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 
461 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
470 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  43.06 
 
 
462 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  43.06 
 
 
462 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.12 
 
 
464 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.36 
 
 
462 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.53 
 
 
459 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.65 
 
 
460 aa  338  9e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.47 
 
 
460 aa  335  7e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.47 
 
 
460 aa  335  7e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.47 
 
 
460 aa  335  7e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42 
 
 
466 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.92 
 
 
469 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.21 
 
 
459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.19 
 
 
459 aa  323  4e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  39.16 
 
 
460 aa  322  8e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.61 
 
 
475 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  42.89 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.57 
 
 
471 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  42.47 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 
456 aa  314  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.55 
 
 
496 aa  310  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.22 
 
 
483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  40.65 
 
 
481 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.87 
 
 
758 aa  306  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.61 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.65 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  41.25 
 
 
503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 
474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 
461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.75 
 
 
499 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.4 
 
 
474 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.53 
 
 
460 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 
461 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.95 
 
 
493 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.84 
 
 
458 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 
462 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.83 
 
 
470 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37 
 
 
461 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  40.23 
 
 
498 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.05 
 
 
481 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
460 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.6 
 
 
462 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.46 
 
 
457 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  40.05 
 
 
499 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  41.33 
 
 
499 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.36 
 
 
497 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.9 
 
 
499 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  40.24 
 
 
499 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  40.86 
 
 
499 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  39.51 
 
 
499 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  39.86 
 
 
500 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  41.09 
 
 
499 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.03 
 
 
464 aa  292  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  40.24 
 
 
499 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  37.83 
 
 
503 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  39.22 
 
 
479 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.66 
 
 
890 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.83 
 
 
460 aa  290  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.8 
 
 
460 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.67 
 
 
496 aa  289  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  39.47 
 
 
497 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.72 
 
 
499 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  39.17 
 
 
499 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
459 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  40.62 
 
 
499 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>