35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1551 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  77.69 
 
 
534 aa  823    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  78.39 
 
 
525 aa  828    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  100 
 
 
560 aa  1163    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  98.4 
 
 
561 aa  1140    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  52.13 
 
 
503 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  53.17 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  53.38 
 
 
505 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  45.96 
 
 
432 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  45.27 
 
 
443 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  42.44 
 
 
444 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  41.15 
 
 
444 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  41.89 
 
 
427 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  41.23 
 
 
439 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  36.18 
 
 
437 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  33.54 
 
 
929 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  35.62 
 
 
450 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  35.7 
 
 
466 aa  246  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  34.83 
 
 
423 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  35.35 
 
 
396 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.94 
 
 
1967 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  28.29 
 
 
424 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  28.67 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  28.01 
 
 
432 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  27.64 
 
 
457 aa  171  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  27.78 
 
 
420 aa  170  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  25.37 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  28.12 
 
 
555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  26.52 
 
 
441 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  26.84 
 
 
460 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  25.82 
 
 
733 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.27 
 
 
457 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  27.25 
 
 
429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  29.58 
 
 
412 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  23.48 
 
 
2716 aa  44.3  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  31.82 
 
 
2929 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>