More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1550 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  99.77 
 
 		 430 aa  886    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  76.09 
 
 		 440 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 430 aa  888    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  69.93 
 
 		 446 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 		 422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  41.63 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 424 aa  216  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  29.56 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.55 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.43 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.9 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.2 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.2 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 504 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 432 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.12 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.85 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  26.21 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 410 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.96 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 428 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.96 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.02 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.68 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.57 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 416 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.33 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.02 
 
 		 430 aa  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.33 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>