196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1403 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  98.27 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.43 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  41.26 
 
 
219 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  41.26 
 
 
219 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  43.75 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  44.44 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  42.17 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  41.46 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  42.17 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  42.17 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  40.74 
 
 
138 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  41.25 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  43.21 
 
 
140 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.77 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  41.25 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  43.02 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  41.25 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  41.25 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  40 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  44.44 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.98 
 
 
288 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  39.02 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.27 
 
 
137 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  38.27 
 
 
137 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  42.5 
 
 
287 aa  62  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  42.5 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  40.24 
 
 
275 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  40.24 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  40 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  42.5 
 
 
274 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  40.24 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  42.5 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  42.86 
 
 
270 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  40 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.98 
 
 
112 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  45.45 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.58 
 
 
193 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.75 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.27 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  38.75 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30.91 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  31.82 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.9 
 
 
237 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  36.25 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  39.02 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  39.02 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.8 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  44.64 
 
 
507 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  38.55 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.03 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  36.59 
 
 
152 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  30.91 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  30.91 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  37.18 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  40.51 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.44 
 
 
390 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  37.97 
 
 
138 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  38.1 
 
 
233 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  38.1 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  33.75 
 
 
413 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  36.59 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  38.1 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  41.46 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  30.86 
 
 
349 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  38.1 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  33.33 
 
 
170 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  42.31 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  35.23 
 
 
371 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  33.33 
 
 
170 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  48.28 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  37.88 
 
 
371 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  33.33 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  38.46 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  34.62 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  32.69 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.33 
 
 
225 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  39.47 
 
 
238 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  40.24 
 
 
266 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  31.65 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  36.25 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.21 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  47.37 
 
 
117 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.36 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  41.77 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  40 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  34.15 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  22.73 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  40 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  37.93 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  34.21 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  30.26 
 
 
368 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  34.18 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  42.11 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>