More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1372 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02463  GTP-binding protein LepA  68.95 
 
 
599 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.412386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1099  GTP-binding protein LepA  68.95 
 
 
599 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000732833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  60.07 
 
 
600 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1431  GTP-binding protein LepA  70.13 
 
 
599 aa  890    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  57.55 
 
 
607 aa  734    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  71.55 
 
 
601 aa  870    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0477  GTP-binding protein LepA  56.69 
 
 
598 aa  726    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0305047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1060  GTP-binding protein LepA  68.39 
 
 
598 aa  814    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.568837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  58.42 
 
 
607 aa  747    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4124  GTP-binding protein LepA  69.13 
 
 
596 aa  861    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1174  GTP-binding protein LepA  56.09 
 
 
598 aa  719    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  57.24 
 
 
610 aa  735    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  60.2 
 
 
602 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  68.07 
 
 
596 aa  863    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4220  GTP-binding protein LepA  69.41 
 
 
595 aa  878    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  58.25 
 
 
607 aa  744    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  58.25 
 
 
607 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl473  GTP-binding protein LepA  55.97 
 
 
600 aa  692    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  58.25 
 
 
607 aa  744    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0541  GTP-binding protein LepA  68.01 
 
 
597 aa  846    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  67.84 
 
 
610 aa  854    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  67.84 
 
 
610 aa  854    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3954  GTP-binding protein LepA  69.24 
 
 
598 aa  877    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0330  GTP-binding protein LepA  67.9 
 
 
598 aa  847    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2026  GTP-binding protein LepA  68.12 
 
 
596 aa  832    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.788972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  56.73 
 
 
614 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  56.41 
 
 
603 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  68.68 
 
 
597 aa  839    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2089  GTP-binding protein LepA  66.1 
 
 
599 aa  823    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  58.71 
 
 
603 aa  750    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  56.15 
 
 
603 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2897  GTP-binding protein LepA  68.01 
 
 
597 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  69.83 
 
 
606 aa  885    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0992  GTP-binding protein LepA  70.25 
 
 
598 aa  889    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.376719  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2088  GTP-binding protein LepA  57.17 
 
 
599 aa  725    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  59.8 
 
 
599 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4244  GTP-binding protein LepA  67.84 
 
 
597 aa  862    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  56.24 
 
 
605 aa  699    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  57.31 
 
 
602 aa  705    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  55.07 
 
 
605 aa  700    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  56.64 
 
 
606 aa  697    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  59.4 
 
 
629 aa  752    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  60.07 
 
 
601 aa  743    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0732  GTP-binding protein LepA  68.24 
 
 
601 aa  800    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000481242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  58.08 
 
 
607 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1637  GTP-binding protein LepA  56.28 
 
 
596 aa  707    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  56.49 
 
 
602 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  57.55 
 
 
604 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  65.66 
 
 
597 aa  850    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3365  GTP-binding protein LepA  58.29 
 
 
621 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  60.54 
 
 
602 aa  759    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1728  GTP-binding protein LepA  68.01 
 
 
597 aa  845    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  59.83 
 
 
601 aa  763    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0469  GTP-binding protein LepA  58.87 
 
 
644 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.942925  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2587  GTP-binding protein LepA  58.89 
 
 
605 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0771  GTP-binding protein LepA  53.87 
 
 
596 aa  687    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0724  GTP-binding protein LepA  53.55 
 
 
598 aa  698    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3431  GTP-binding protein LepA  58.39 
 
 
599 aa  735    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1740  GTP-binding protein LepA  63.62 
 
 
603 aa  812    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0723803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2246  GTP-binding protein LepA  69.97 
 
 
599 aa  876    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0591  GTP-binding protein LepA  59.9 
 
 
637 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10515  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  68.68 
 
 
597 aa  843    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  68.68 
 
 
597 aa  843    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  63.29 
 
 
603 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1083  GTP-binding protein LepA  68.01 
 
 
597 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.632342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  67.45 
 
 
596 aa  851    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0373  GTP-binding protein LepA  59.04 
 
 
644 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.598212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1629  GTP-binding protein LepA  66.55 
 
 
606 aa  838    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  59.14 
 
 
610 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0364  GTP-binding protein LepA  67.9 
 
 
598 aa  846    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  68.17 
 
 
597 aa  841    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0283  GTP-binding protein LepA  65.16 
 
 
602 aa  793    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.921384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  61.49 
 
 
601 aa  759    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1624  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
595 aa  702    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.440773  normal  0.182126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0678  GTP-binding protein LepA  54.87 
 
 
599 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2036  GTP-binding protein LepA  59.44 
 
 
607 aa  735    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.270198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0652  GTP-binding protein LepA  67.67 
 
 
597 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1516  GTP-binding protein LepA  55.82 
 
 
600 aa  677    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3151  GTP-binding protein LepA  67.28 
 
 
598 aa  839    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000523336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  58.8 
 
 
605 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  53.77 
 
 
596 aa  682    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  58.26 
 
 
600 aa  721    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  58.43 
 
 
600 aa  722    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1242  GTP-binding protein LepA  69.02 
 
 
598 aa  849    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  56.57 
 
 
601 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  68.24 
 
 
596 aa  863    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  68.24 
 
 
596 aa  863    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  69.01 
 
 
627 aa  871    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2931  GTP-binding protein LepA  67.11 
 
 
596 aa  848    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0135754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  57.38 
 
 
599 aa  706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  58.8 
 
 
608 aa  750    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1008  GTP-binding protein LepA  67.67 
 
 
597 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54370  GTP-binding protein LepA  70.13 
 
 
599 aa  885    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  56.64 
 
 
607 aa  718    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0824  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 
612 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  54.19 
 
 
620 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  58.18 
 
 
610 aa  736    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1132  GTP-binding protein LepA  67.67 
 
 
597 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  61.91 
 
 
598 aa  777    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  68.07 
 
 
596 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>