51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1099 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  96.28 
 
 
215 aa  390  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  66.03 
 
 
214 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  62.2 
 
 
211 aa  225  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  34.18 
 
 
192 aa  88.2  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  32.99 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.67 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  27.67 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  30.2 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  28.64 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  25.24 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  25.24 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  27 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  27 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  29.5 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  25.25 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  27.04 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  29.65 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  28.37 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  27.6 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  34.95 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  23.41 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  27.41 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  25.37 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  29.91 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  26.6 
 
 
214 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  24.75 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  29.95 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  22.82 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  32.04 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  34.91 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  27.17 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  31.53 
 
 
222 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  28.44 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  25.12 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  24.38 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  22.82 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  29.38 
 
 
201 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  25.59 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  25.38 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  22.75 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  28.44 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  24.54 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  24.64 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  25.44 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  28.57 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  24.87 
 
 
208 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  24.88 
 
 
207 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>