28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1066 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  67.11 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  31.82 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  32.58 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  32.58 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  28.12 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1431  hypothetical protein  48.44 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000064754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  29.71 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3089  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000107879  hitchhiker  0.0000721091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.93 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.93 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  28.8 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.41 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.71 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.17 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  31.53 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2265  hypothetical protein  42.19 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 283 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  24.38 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  30 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  29.75 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  25.19 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  24.69 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.99 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  29.25 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  29.59 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  33.93 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>