186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0894 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  74.43 
 
 		 176 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  71.59 
 
 		 176 aa  240  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  34.3 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  34.3 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  32.69 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  33.14 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  33.14 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  27.38 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  31.25 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  30.11 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  31.4 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  31.82 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  31.21 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  30.81 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  32.19 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  30.34 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  29.48 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.64 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  27.75 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  28.38 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  27.59 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  30.34 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  31.43 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  28.9 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  30.43 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  29.37 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.9 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  28.87 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  32.67 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  32.21 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  33.07 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  36.17 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  32.89 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  31.08 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  27.45 
 
 		 478 aa  51.2  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  30.91 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  24.26 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  29.21 
 
 		 520 aa  50.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  24.19 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  42.86 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  20.69 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  25 
 
 		 518 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  34.4 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  30.07 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  29.58 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  27.45 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  31.87 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  24.31 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  30.86 
 
 		 466 aa  47.8  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.63 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  30.28 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  31.82 
 
 		 515 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  26.26 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  54.05 
 
 		 317 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  28.28 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  20.83 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  21.66 
 
 		 907 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  31.37 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  32.26 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  32.39 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  29.58 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  30.59 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  30 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.52 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  38.46 
 
 		 312 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  26.04 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.87 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 		 444 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.57 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  50 
 
 		 320 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  24.65 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  55.88 
 
 		 325 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  40.38 
 
 		 314 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  35.06 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  30.77 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  33.73 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  22.54 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  25 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.47 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  35.06 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  41.51 
 
 		 311 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  32.71 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  36.62 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0218  cheW domain-containing protein  29.41 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0967  cheW domain-containing protein  29.41 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  29.49 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  25.25 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2371  putative CheW protein  32.18 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220731 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2541  CheW domain-containing protein  29.41 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0255  cheW domain-containing protein  29.41 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  36.54 
 
 		 317 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  38.46 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  35.21 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  45.28 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  24.81 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>