More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0871 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
203 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  98.03 
 
 
203 aa  417  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  83.16 
 
 
203 aa  342  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  86.1 
 
 
190 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  67.76 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 
209 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 
211 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 
209 aa  261  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 
211 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 
211 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
242 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  61.9 
 
 
210 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
292 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
292 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
292 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
292 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
292 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  63.44 
 
 
236 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  64.48 
 
 
206 aa  257  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  64.02 
 
 
212 aa  256  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  61.75 
 
 
212 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  61.75 
 
 
212 aa  255  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  62.3 
 
 
205 aa  254  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 
190 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  59.16 
 
 
211 aa  247  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  58.7 
 
 
206 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  58.73 
 
 
192 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  54.36 
 
 
206 aa  234  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  58.43 
 
 
204 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  58.15 
 
 
200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  55.61 
 
 
211 aa  231  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  58.1 
 
 
222 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 
213 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 
213 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 
213 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 
272 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
219 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  61.15 
 
 
204 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
269 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
222 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 
201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  61.15 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 
242 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 
213 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 
219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  51.56 
 
 
213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
229 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  53.26 
 
 
210 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 
241 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  52.82 
 
 
213 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 
229 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 
234 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  49.22 
 
 
234 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
232 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  47.8 
 
 
206 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  51.27 
 
 
216 aa  203  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  52.51 
 
 
226 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  46.35 
 
 
213 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
188 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 
224 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 
239 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 
239 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  48.95 
 
 
214 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  48.95 
 
 
214 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 
190 aa  191  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 
195 aa  191  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  51.41 
 
 
226 aa  191  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 
216 aa  190  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  48.96 
 
 
218 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 
192 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 
190 aa  189  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 
235 aa  189  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 
235 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 
247 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  50.84 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  47.64 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  49.42 
 
 
179 aa  187  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  48.5 
 
 
198 aa  187  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  51.1 
 
 
190 aa  187  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 
206 aa  187  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  47.67 
 
 
219 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  49.17 
 
 
235 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  48.88 
 
 
213 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  48.22 
 
 
223 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 
188 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  49.19 
 
 
188 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  52.87 
 
 
198 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  49.24 
 
 
203 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>