More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0726 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  77.05 
 
 
414 aa  683    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
416 aa  856    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  76.73 
 
 
418 aa  670    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  99.52 
 
 
416 aa  852    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51 
 
 
417 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
416 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 
413 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  50.87 
 
 
420 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.88 
 
 
413 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  48.07 
 
 
414 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  50.5 
 
 
413 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  46.29 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  46.29 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  45.95 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
406 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
451 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 
406 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  47.72 
 
 
419 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.63 
 
 
427 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.61 
 
 
429 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.51 
 
 
404 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
418 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.39 
 
 
413 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.39 
 
 
413 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.89 
 
 
420 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.01 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  49.5 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  49.5 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.01 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.01 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  48.02 
 
 
406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.76 
 
 
429 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.21 
 
 
413 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.92 
 
 
421 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.15 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  47.89 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  47.2 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  48.26 
 
 
415 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.4 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  49 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.77 
 
 
406 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.24 
 
 
404 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.39 
 
 
404 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.78 
 
 
415 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  48 
 
 
608 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  47.39 
 
 
414 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.88 
 
 
412 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  48.62 
 
 
414 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.2 
 
 
414 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  46.5 
 
 
423 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.41 
 
 
419 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.98 
 
 
420 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.63 
 
 
406 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  47.51 
 
 
406 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.51 
 
 
406 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.51 
 
 
406 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.03 
 
 
415 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.01 
 
 
406 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.91 
 
 
419 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  46.29 
 
 
420 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  45.41 
 
 
429 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  47.51 
 
 
406 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.03 
 
 
415 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.76 
 
 
406 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  48.96 
 
 
408 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.79 
 
 
414 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.01 
 
 
406 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 
425 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  43.86 
 
 
406 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.26 
 
 
406 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  43.86 
 
 
406 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  43.86 
 
 
406 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  44.53 
 
 
412 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.51 
 
 
406 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.85 
 
 
420 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  44.11 
 
 
406 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.53 
 
 
428 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.61 
 
 
406 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.26 
 
 
406 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  46.52 
 
 
406 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.26 
 
 
406 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  44.11 
 
 
406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  43 
 
 
414 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  44.11 
 
 
406 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.77 
 
 
406 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  46.52 
 
 
404 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  43.86 
 
 
406 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  45.17 
 
 
414 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.26 
 
 
406 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  43.86 
 
 
406 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  46.45 
 
 
682 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.64 
 
 
408 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.86 
 
 
406 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.48 
 
 
679 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>