More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0611 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  100 
 
 
180 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  98.89 
 
 
180 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  58.89 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  56.11 
 
 
180 aa  214  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  41.28 
 
 
174 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  41.57 
 
 
172 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  42.6 
 
 
171 aa  148  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  42.77 
 
 
180 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  43.2 
 
 
171 aa  147  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  43.2 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  42.86 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  42.01 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  42.42 
 
 
172 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  39.64 
 
 
180 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  43.37 
 
 
171 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  44.1 
 
 
175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  44.1 
 
 
175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  42.42 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  42.01 
 
 
171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  45.22 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  42.17 
 
 
171 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  47.71 
 
 
179 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  44.1 
 
 
172 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  42.86 
 
 
172 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  40.83 
 
 
171 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  45.24 
 
 
167 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  42.01 
 
 
171 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  41.42 
 
 
171 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  43.48 
 
 
172 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  42.24 
 
 
172 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  40.12 
 
 
173 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  39.76 
 
 
172 aa  140  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  41.57 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  39.52 
 
 
173 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  39.88 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  39.88 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  38.15 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  39.88 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.57 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  39.88 
 
 
173 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  39.52 
 
 
173 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  39.52 
 
 
173 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  39.52 
 
 
173 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  39.52 
 
 
173 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  39.52 
 
 
173 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  43.21 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  42.51 
 
 
172 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  42.58 
 
 
163 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  41.32 
 
 
172 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  38.24 
 
 
179 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  40.96 
 
 
171 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  38.92 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  38.92 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  38.92 
 
 
225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  38.92 
 
 
173 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  42.04 
 
 
163 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  43.79 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  40 
 
 
172 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  40 
 
 
172 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  40.25 
 
 
176 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  44.9 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  40.48 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  39.88 
 
 
184 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  37.65 
 
 
179 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  40.61 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  39.88 
 
 
184 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  39.88 
 
 
199 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  39.88 
 
 
209 aa  131  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  38.92 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  39.88 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  40.85 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  40.24 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  40.24 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  40.24 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  40.24 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  40.24 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  40.24 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  42.28 
 
 
192 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  40.76 
 
 
183 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  40.24 
 
 
183 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  38.79 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  41.98 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  41.98 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  41.4 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  42.28 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  41.4 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  40.76 
 
 
169 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>