272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0588 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 316 aa  620  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  99.05 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  74.64 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  72.5 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  41.43 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  41.43 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  39.69 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  40.86 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  41.31 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  42.25 
 
 		 286 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  40.08 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  40.46 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 359 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  39.13 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  34.6 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  38.43 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  37.69 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  38.74 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  41.04 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  41.2 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  37.35 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  37.16 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  36.96 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  38.49 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  37.45 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  37.09 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  36.96 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  36.96 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  36.96 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  36.53 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  38.5 
 
 		 243 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  36.04 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  37.39 
 
 		 277 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  35.02 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  37.31 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  36.51 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  36.51 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  36.4 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  37.55 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  37.16 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  34.9 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  37.25 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  37.25 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  33.72 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  37.7 
 
 		 353 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  37.7 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  37.7 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  36.58 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  36.19 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  33.45 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  36.9 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  35.61 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  35.39 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  36.1 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  33.83 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  36.19 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  33.83 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  33.83 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  35.65 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 369 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>