More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0315 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  100 
 
 
435 aa  878    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  98.39 
 
 
450 aa  865    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  63.97 
 
 
501 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  45.73 
 
 
446 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  42.34 
 
 
590 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  42.34 
 
 
590 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  44.81 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  43.84 
 
 
580 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  42.28 
 
 
565 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  42.44 
 
 
609 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  41.89 
 
 
584 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  42.19 
 
 
565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  39.41 
 
 
448 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  40.62 
 
 
609 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
570 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
593 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  40.61 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  39.05 
 
 
569 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  40.27 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  29.32 
 
 
457 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  31.41 
 
 
591 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  27.65 
 
 
466 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  28.08 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  27.82 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  23.8 
 
 
448 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
557 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
557 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  27.55 
 
 
455 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
551 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  26.58 
 
 
454 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 
565 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  29.17 
 
 
393 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  26.1 
 
 
454 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  27.07 
 
 
454 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
562 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  25.96 
 
 
454 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  26.74 
 
 
563 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  25.96 
 
 
454 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 
453 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  25.96 
 
 
454 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
559 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  28.14 
 
 
453 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  25.96 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  26.27 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  26.27 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  26.27 
 
 
459 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
557 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  26.27 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  26.06 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 
568 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
615 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  27.98 
 
 
524 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
563 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
563 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  27.41 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0035  AMP-dependent synthetase and ligase  22.97 
 
 
571 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  27.13 
 
 
541 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  22.61 
 
 
629 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  24.58 
 
 
507 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  22.07 
 
 
629 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.47 
 
 
568 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  28.46 
 
 
1346 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  23.99 
 
 
551 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  25.94 
 
 
469 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  26.27 
 
 
510 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1819  4-coumarate--CoA ligase  28.43 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0064272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.13 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  27.58 
 
 
480 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 
504 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.7 
 
 
518 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.33 
 
 
7168 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  31.36 
 
 
3650 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
430 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3397  putative acyl-CoA synthetase  22.05 
 
 
487 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.16 
 
 
514 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  26.63 
 
 
467 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 
605 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  22.13 
 
 
549 aa  60.1  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  33.05 
 
 
550 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  22.46 
 
 
467 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  26.11 
 
 
469 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  24.29 
 
 
521 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  24.29 
 
 
521 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  24.29 
 
 
521 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  24.29 
 
 
521 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  24.22 
 
 
570 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 
545 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  24.29 
 
 
521 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  22.37 
 
 
543 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  25.98 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  24.55 
 
 
526 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>