More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0206 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  92.37 
 
 		 949 aa  1613    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  72.42 
 
 		 909 aa  1319    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 970 aa  1943    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  51.56 
 
 		 942 aa  838    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  70.99 
 
 		 965 aa  1307    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  92.53 
 
 		 970 aa  1625    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.84 
 
 		 947 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.83 
 
 		 926 aa  291  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.46 
 
 		 915 aa  289  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.23 
 
 		 910 aa  286  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.47 
 
 		 913 aa  277  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.76 
 
 		 906 aa  265  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  30.01 
 
 		 959 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.02 
 
 		 979 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  29.95 
 
 		 911 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.37 
 
 		 954 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.32 
 
 		 1055 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  29.54 
 
 		 974 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.02 
 
 		 1038 aa  179  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.42 
 
 		 1004 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  27 
 
 		 1028 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.92 
 
 		 1033 aa  168  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  28.02 
 
 		 991 aa  164  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 1006 aa  158  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  27.52 
 
 		 1001 aa  153  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.86 
 
 		 1125 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.69 
 
 		 995 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.32 
 
 		 1001 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.79 
 
 		 983 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.89 
 
 		 1154 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.75 
 
 		 710 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.51 
 
 		 1134 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1325 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.6 
 
 		 1179 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.45 
 
 		 1156 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1446 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.78 
 
 		 1175 aa  93.6  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 754 aa  88.6  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  38.89 
 
 		 657 aa  88.2  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  38.73 
 
 		 652 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  37.56 
 
 		 652 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.97 
 
 		 634 aa  85.5  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  35.5 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  27.92 
 
 		 1121 aa  84.7  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 		 718 aa  84  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.44 
 
 		 995 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.8 
 
 		 1177 aa  83.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.29 
 
 		 452 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.62 
 
 		 661 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  26.76 
 
 		 1041 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  26.76 
 
 		 1041 aa  82.4  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  27.82 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.32 
 
 		 816 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  37.02 
 
 		 653 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 		 635 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.35 
 
 		 1782 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.11 
 
 		 1489 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.76 
 
 		 348 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.67 
 
 		 1532 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.2 
 
 		 634 aa  75.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.13 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25.84 
 
 		 986 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.36 
 
 		 919 aa  74.7  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.14 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.67 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  24.32 
 
 		 1119 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.26 
 
 		 1081 aa  72  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.9 
 
 		 1029 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.41 
 
 		 398 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 		 627 aa  70.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 1164 aa  70.5  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.54 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.75 
 
 		 1361 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.89 
 
 		 1285 aa  70.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.92 
 
 		 1011 aa  69.7  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0755  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.312676  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.74 
 
 		 959 aa  69.3  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  27.07 
 
 		 1129 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  27.07 
 
 		 1131 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  27.07 
 
 		 1131 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  27.07 
 
 		 1131 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  27.07 
 
 		 1131 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  27.07 
 
 		 1131 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.98 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  24.69 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 770 aa  67.8  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  26.85 
 
 		 1129 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.19 
 
 		 1848 aa  67.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  26.49 
 
 		 2711 aa  67.4  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  27.68 
 
 		 644 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.87 
 
 		 710 aa  66.6  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  96.88 
 
 		 998 aa  66.6  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  35.83 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.07 
 
 		 3506 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>