81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0137 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  96.38 
 
 		 138 aa  226  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  65.49 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  56.03 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  42.75 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  39.57 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  45.6 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  38.69 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  36.43 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  39.86 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  42.02 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  39.13 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  40.31 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  39.31 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  42.62 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  42.62 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  37.31 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  39.86 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  34.78 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  39.5 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  40.44 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  35.66 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  41.3 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  39.86 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  38.06 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  33.83 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  36.69 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  36.5 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  32.61 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  35.04 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  32.61 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  32.61 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  33.58 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  31.88 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  31.88 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  31.88 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  31.88 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  31.88 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  33.09 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  32.35 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  36.76 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  36.76 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  36.76 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  31.11 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  33.58 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  33.58 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  33.58 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  33.58 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  30.99 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  36.17 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.14 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  27.54 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  27.83 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  25.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  25 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  28.08 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  27.37 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  22.14 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  22.38 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.47 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  24.44 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  29.47 
 
 		 157 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  26.57 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  28.26 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  28.26 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  28.26 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  22.14 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  28.26 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  26.39 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  26.06 
 
 		 150 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>