More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0042 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  100 
 
 		 346 aa  709    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  99.42 
 
 		 346 aa  701    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  70.19 
 
 		 345 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  63.27 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  65.75 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  65.44 
 
 		 330 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  59.46 
 
 		 302 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  52.17 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  49.68 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  56.25 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  55.69 
 
 		 474 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  55.69 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  55.69 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  55.69 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  55.69 
 
 		 306 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  53.51 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  52.77 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  54.51 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  54.51 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  54.51 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  54.51 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  53.52 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  48.14 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  54.12 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  50.72 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  51.19 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  46.94 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  46.6 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  47.35 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  54.2 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  54.2 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  48.04 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  49.02 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  44.8 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  45.59 
 
 		 327 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  49.15 
 
 		 298 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.56 
 
 		 320 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.62 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  39.15 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.13 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  39.44 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  39.04 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  39.04 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  36.79 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  48.84 
 
 		 223 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  44.44 
 
 		 216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  36.54 
 
 		 275 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.89 
 
 		 256 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.18 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.62 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.6 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  36.4 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.38 
 
 		 275 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  35.71 
 
 		 728 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.71 
 
 		 727 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  34.34 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.71 
 
 		 728 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  43.41 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  35.71 
 
 		 751 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  36.16 
 
 		 276 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.66 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  34.97 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  41.27 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.87 
 
 		 733 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  35.88 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  35.64 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  34.32 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  33.12 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.75 
 
 		 263 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.75 
 
 		 263 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.75 
 
 		 263 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.75 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.32 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.75 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.75 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  41.62 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.86 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  41.99 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  33.56 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  40.88 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  33.98 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  33.11 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.59 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.44 
 
 		 728 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.9 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  32.67 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  34.01 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  33.22 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  36.47 
 
 		 852 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.52 
 
 		 667 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  32.33 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.47 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  40.98 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  33 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  33 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  33 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  33.55 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  33 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  33.11 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.47 
 
 		 263 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>