26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0022 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  95.9 
 
 		 195 aa  359  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  55.74 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  43.94 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  30.38 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  41.35 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  44.16 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  40.91 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  41.05 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  42.62 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  40.82 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  38.71 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  28.48 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0018  putative Tfp pilus assembly protein  27.5 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  36.14 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0736  hypothetical protein  24.46 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  28.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  62.96 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  33.33 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  29.76 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  34.23 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  52.73 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2943  fimbrial biogenesis protein  25.9 
 
 		 434 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.664137  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  62.07 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  47.54 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0217  hypothetical protein  37.7 
 
 		 400 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.714135  normal  0.0525826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>