37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0008 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
397 aa  793    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  97.23 
 
 
397 aa  707    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  68.84 
 
 
397 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  61.79 
 
 
395 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  26.16 
 
 
407 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  25.87 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  23.96 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  24.29 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  24.06 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  23.21 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  23.23 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  21.16 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  23.81 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  23.44 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  24.53 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  22.87 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0874  tetratricopeptide domain-containing protein  22.44 
 
 
510 aa  63.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  22.26 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  23.51 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  22.81 
 
 
441 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
1297 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  24.81 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  24 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  21.84 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
467 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
562 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
589 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.44 
 
 
810 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>