More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3368 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  100 
 
 
330 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  78.32 
 
 
332 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  75.78 
 
 
340 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  76.75 
 
 
333 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  74.05 
 
 
313 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  71.78 
 
 
346 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  69.97 
 
 
359 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  73.79 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  70.3 
 
 
319 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  71.75 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  71.62 
 
 
310 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  73.2 
 
 
329 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.43 
 
 
310 aa  431  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  74.18 
 
 
327 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  65.03 
 
 
353 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  68.51 
 
 
310 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
348 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  65.92 
 
 
330 aa  414  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  63.69 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  67.72 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  67.65 
 
 
317 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  63.75 
 
 
318 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  69.97 
 
 
309 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  63.21 
 
 
333 aa  407  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  69.31 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  63.52 
 
 
310 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  65.61 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  65.61 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  65.61 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  62.77 
 
 
331 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  66.01 
 
 
336 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  61.16 
 
 
335 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  64.03 
 
 
330 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  64.19 
 
 
361 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  65.81 
 
 
317 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  64.89 
 
 
362 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  64.14 
 
 
331 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  62.7 
 
 
327 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  60.77 
 
 
318 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  64.55 
 
 
325 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  57.38 
 
 
313 aa  363  2e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  54.35 
 
 
339 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  56.82 
 
 
334 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  55.05 
 
 
325 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  59.37 
 
 
320 aa  351  8e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  56.29 
 
 
334 aa  347  1e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  55.37 
 
 
311 aa  345  7e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  56.81 
 
 
319 aa  344  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  54.4 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  55.56 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  58.75 
 
 
325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.75 
 
 
311 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  55.45 
 
 
332 aa  331  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.75 
 
 
311 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  54.07 
 
 
311 aa  325  6e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  55.48 
 
 
314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  55.48 
 
 
314 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.47 
 
 
311 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  55.41 
 
 
325 aa  322  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
311 aa  322  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  55.95 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  54.58 
 
 
320 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.25 
 
 
321 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.34 
 
 
326 aa  310  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  54.1 
 
 
335 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
323 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  51.27 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
317 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  49.67 
 
 
315 aa  309  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
312 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
321 aa  308  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  47.71 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.15 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  51.76 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  51.27 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  51.49 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  46.87 
 
 
342 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  49.69 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
322 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  50.79 
 
 
322 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  48.44 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>