More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3355 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  87.23 
 
 		 95 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  79.79 
 
 		 97 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  77.08 
 
 		 96 aa  159  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  72.34 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  72.34 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  64.58 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  65.62 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 96 aa  140  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  68.04 
 
 		 98 aa  140  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 96 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  65.26 
 
 		 95 aa  140  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  69.15 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  69.15 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  69.15 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  68.09 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  66.3 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  68.42 
 
 		 95 aa  137  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  62.77 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  65.62 
 
 		 96 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  64.58 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  66.3 
 
 		 94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  66.3 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  63.83 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  59.38 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  60.42 
 
 		 96 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  60.82 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  61.54 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  58.51 
 
 		 101 aa  126  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  59.41 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  63.74 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  51.02 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  53.19 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  40.21 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  35.79 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  39.08 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1057  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.66834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>