More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3190 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  100 
 
 
351 aa  698    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  59.26 
 
 
329 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  55.67 
 
 
381 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  53.69 
 
 
336 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  53.01 
 
 
351 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  51.82 
 
 
330 aa  328  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  53.16 
 
 
335 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  54.21 
 
 
317 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  54.21 
 
 
317 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  54.21 
 
 
317 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  51 
 
 
321 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  50.43 
 
 
321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  50.71 
 
 
329 aa  308  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  51.44 
 
 
319 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  50.7 
 
 
343 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  53.01 
 
 
332 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  47.71 
 
 
335 aa  289  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  47.4 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  46.05 
 
 
324 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  46.91 
 
 
336 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  46.7 
 
 
322 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  42.48 
 
 
348 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  44.54 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  41.03 
 
 
338 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  40.13 
 
 
332 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  43.28 
 
 
315 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  37.24 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  43.65 
 
 
301 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  41.22 
 
 
297 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  41.41 
 
 
313 aa  205  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  39.78 
 
 
301 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
309 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  38.14 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  38.14 
 
 
307 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  37.8 
 
 
308 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  37.22 
 
 
307 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  36.89 
 
 
307 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  36.89 
 
 
307 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  36.89 
 
 
307 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  38.75 
 
 
307 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  41.73 
 
 
293 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  41.73 
 
 
293 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  39.71 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  41.76 
 
 
304 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  40.37 
 
 
296 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  40.98 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  40.6 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  40.23 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  40.6 
 
 
293 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  35.64 
 
 
307 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  40.98 
 
 
340 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  39.93 
 
 
294 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  38.93 
 
 
290 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 
305 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  39.85 
 
 
293 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  37.95 
 
 
306 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  35.31 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  38.06 
 
 
306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  39.53 
 
 
312 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  39.53 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  38.89 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  37.58 
 
 
306 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  37.37 
 
 
306 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.86 
 
 
296 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  40 
 
 
312 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  37.42 
 
 
307 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  37.79 
 
 
307 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  37.63 
 
 
294 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  37.85 
 
 
305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  40.57 
 
 
301 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  38.71 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  39.45 
 
 
301 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  40.86 
 
 
296 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  37.63 
 
 
294 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  39.64 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  37.5 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  34.27 
 
 
290 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  36.84 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  36.72 
 
 
311 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  35.96 
 
 
291 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  37.28 
 
 
305 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  37.28 
 
 
293 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
293 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  39.48 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  36.93 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  37.28 
 
 
305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
311 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  38.57 
 
 
307 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  37.41 
 
 
310 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  35.66 
 
 
287 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  39.64 
 
 
307 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  35.52 
 
 
291 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.5 
 
 
291 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  31.6 
 
 
310 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  38.28 
 
 
311 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  36.09 
 
 
291 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  40.23 
 
 
293 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>