272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3146 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  100 
 
 
459 aa  917    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  57.27 
 
 
446 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  59.18 
 
 
491 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  60.36 
 
 
469 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  48.43 
 
 
870 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.14 
 
 
422 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  42.72 
 
 
341 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  44.67 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  43.2 
 
 
323 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  43.49 
 
 
330 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  42.55 
 
 
439 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  43.02 
 
 
346 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  44.03 
 
 
329 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  44.03 
 
 
329 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  44.03 
 
 
329 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  43.36 
 
 
495 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  33.28 
 
 
605 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  41.05 
 
 
448 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40.14 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  41.87 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.07 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  38.91 
 
 
341 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  41.26 
 
 
465 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  40.07 
 
 
438 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  40 
 
 
393 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.41 
 
 
590 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  38.31 
 
 
326 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  30.2 
 
 
588 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  40.14 
 
 
359 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  29.65 
 
 
596 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  39.24 
 
 
487 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  30.54 
 
 
611 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  32.44 
 
 
469 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 
589 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  33.24 
 
 
419 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  39.17 
 
 
773 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.79 
 
 
486 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 
620 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  53.85 
 
 
744 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.36 
 
 
479 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
633 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  39.77 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 
854 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  60.36 
 
 
767 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.32 
 
 
743 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  33.22 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  50 
 
 
488 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  54.37 
 
 
774 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  55.24 
 
 
681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  52.83 
 
 
746 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  36.13 
 
 
361 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  50.5 
 
 
925 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  44.44 
 
 
669 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  49.59 
 
 
785 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  33.23 
 
 
350 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  55.45 
 
 
979 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 
842 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  51.92 
 
 
495 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  44.62 
 
 
485 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  42.04 
 
 
963 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  45.13 
 
 
1128 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.79 
 
 
499 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 
609 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  33.33 
 
 
394 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 
812 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  41.04 
 
 
1042 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.95 
 
 
846 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  48.92 
 
 
966 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  30.13 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  39.16 
 
 
501 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  58.06 
 
 
477 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  52.83 
 
 
420 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  47.86 
 
 
681 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  46.3 
 
 
974 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.36 
 
 
469 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  48.04 
 
 
913 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43.7 
 
 
847 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  38.74 
 
 
1055 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  52.27 
 
 
673 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  50.5 
 
 
353 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  45.63 
 
 
372 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
990 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.63 
 
 
422 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  50.59 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  49.02 
 
 
494 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  55.24 
 
 
775 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.27 
 
 
984 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.62 
 
 
366 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  48.54 
 
 
690 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  50 
 
 
829 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.62 
 
 
474 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  37.95 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  49.56 
 
 
727 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  25.66 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  45.61 
 
 
694 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.04 
 
 
778 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  47.57 
 
 
854 aa  87.4  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.15 
 
 
934 aa  87.4  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 
628 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  47.15 
 
 
533 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>