147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2959 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 160 aa  318  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  93.12 
 
 		 160 aa  301  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  89.38 
 
 		 161 aa  289  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  88.75 
 
 		 160 aa  289  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  86.25 
 
 		 160 aa  280  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 160 aa  277  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  86.25 
 
 		 160 aa  277  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  93.12 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  85 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  83.75 
 
 		 160 aa  268  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 160 aa  265  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 160 aa  265  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  83.12 
 
 		 160 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  81.88 
 
 		 162 aa  264  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  84.18 
 
 		 160 aa  261  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  81.88 
 
 		 160 aa  260  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  80.62 
 
 		 163 aa  260  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  81.25 
 
 		 160 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  80 
 
 		 160 aa  258  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  80 
 
 		 160 aa  257  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  79.38 
 
 		 162 aa  257  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  80.38 
 
 		 163 aa  257  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  78.75 
 
 		 162 aa  256  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 162 aa  254  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 162 aa  253  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 162 aa  253  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 162 aa  253  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  77.5 
 
 		 162 aa  253  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  85 
 
 		 160 aa  252  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  78.88 
 
 		 161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  77.5 
 
 		 160 aa  250  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  81.88 
 
 		 160 aa  245  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  73.42 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  72.96 
 
 		 161 aa  233  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  67.5 
 
 		 162 aa  232  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  57.96 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  55.41 
 
 		 197 aa  169  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  167  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  53.46 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  48.08 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  45.57 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  46.5 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  46.84 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  44.38 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  42.04 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  37.58 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  33.97 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  33.97 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  35.26 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  34.62 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  32.28 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  32.28 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  32.24 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  35.22 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  31.58 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 188 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  33.12 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  30.26 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  34.81 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  28.29 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  31.06 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7543  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  34.87 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0412  transcription factor CarD  33.11 
 
 		 283 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  31.25 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0187  CarD family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0489  transcriptional regulator, CarD family  32.43 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  31.06 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>