197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2914 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
440 aa  874    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.86 
 
 
429 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
444 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
478 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
462 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  26.06 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  26.9 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.93 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.8 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  25.17 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.06 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  29.52 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.06 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.67 
 
 
434 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  28.74 
 
 
424 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.37 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
498 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
417 aa  60.1  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
421 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 
470 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
434 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  24.93 
 
 
452 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  48.08 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
444 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  28.81 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  24.67 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
544 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.64 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 
422 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
427 aa  54.3  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
450 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
485 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
433 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
441 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
451 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
411 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
448 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
432 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 
445 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  30.62 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 
493 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  23.77 
 
 
457 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 
475 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  27.94 
 
 
447 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
451 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>