127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2893 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 500 aa  966    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  34.98 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  34.98 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  33.7 
 
 		 497 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  37.24 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  33.99 
 
 		 575 aa  197  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  34.32 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  34.05 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  34.87 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  29.91 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 501 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  33.5 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  32.47 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  30.36 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  31.91 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  33.24 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  30.69 
 
 		 514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  28.57 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.21 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  23.27 
 
 		 492 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  23.58 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  23.58 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  23.58 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  23.58 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.22 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.22 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  23.36 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  23.05 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  23.05 
 
 		 492 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.74 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.96 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.74 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.74 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.96 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 503 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.62 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 475 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 497 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  19.43 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 		 507 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.21 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 448 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.76 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  22.33 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  20.13 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  24.3 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>