48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2879 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  100 
 
 
470 aa  922    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  47.03 
 
 
472 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  46.49 
 
 
472 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  45.65 
 
 
475 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  47.7 
 
 
472 aa  329  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  33.26 
 
 
480 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  31.04 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  29.37 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  28.35 
 
 
464 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  26.53 
 
 
462 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  26.85 
 
 
470 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  25.73 
 
 
462 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  27.07 
 
 
469 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  24.81 
 
 
454 aa  118  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.32 
 
 
460 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  27.87 
 
 
463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  25.23 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.97 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  27.77 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  25.93 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  28.54 
 
 
456 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.47 
 
 
463 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  26.1 
 
 
469 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  25.95 
 
 
464 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  27.45 
 
 
463 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  26.27 
 
 
460 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  25.17 
 
 
496 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  27.71 
 
 
471 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  26.76 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  26.57 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  26.91 
 
 
457 aa  96.7  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  25.59 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  26.84 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  22.71 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  26.67 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  23.57 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  21.07 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  20.3 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.37 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.54 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  24.53 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  21.81 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0841  hypothetical protein  44.05 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.66 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  25.62 
 
 
501 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  23.39 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  25.41 
 
 
454 aa  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  24.29 
 
 
485 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>