101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2807 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  65 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  64.41 
 
 
145 aa  158  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  67.8 
 
 
134 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  66.39 
 
 
136 aa  154  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  67.52 
 
 
134 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  67.52 
 
 
134 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  61.02 
 
 
135 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  61.02 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  60.34 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  62.39 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  60.68 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  57.14 
 
 
133 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  64.17 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  57.63 
 
 
130 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  56.03 
 
 
132 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  58.62 
 
 
132 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  57.5 
 
 
133 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  55.46 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  55.17 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  55.93 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  55.56 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  53.78 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  55.17 
 
 
136 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  55.08 
 
 
135 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  55.56 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  55.17 
 
 
163 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  56.03 
 
 
141 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  54.31 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  36.13 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.19 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  40.91 
 
 
263 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  39.39 
 
 
378 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  39.73 
 
 
356 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.97 
 
 
380 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  34.29 
 
 
257 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  37.1 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  37.1 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  43.84 
 
 
361 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  36.36 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  29.7 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  40.32 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  37.88 
 
 
263 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  36.36 
 
 
452 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  34.55 
 
 
351 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  35.94 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
266 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  39.68 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
263 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.32 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
263 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  35.48 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  40.32 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  35.48 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  32.88 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  31.76 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  27.12 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  36.36 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  35.71 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  36.36 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  33.87 
 
 
71 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  33.87 
 
 
71 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  33.77 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  41.27 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  35.94 
 
 
141 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
268 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  38.81 
 
 
278 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1530  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.03 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
268 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  42.86 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.74 
 
 
367 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  35.71 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
274 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  38.36 
 
 
265 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  38.1 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  33.33 
 
 
260 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  34.78 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  34.85 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  32.29 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.46 
 
 
140 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  32.29 
 
 
282 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  32.29 
 
 
282 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  32.29 
 
 
282 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  32.29 
 
 
282 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  34.33 
 
 
68 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 
142 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  33.87 
 
 
71 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  36.92 
 
 
268 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 
364 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  33.87 
 
 
71 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>