149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2789 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  100 
 
 
358 aa  722    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  68.01 
 
 
365 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  59.75 
 
 
321 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  57.58 
 
 
362 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  54.09 
 
 
362 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  54.11 
 
 
366 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  53.67 
 
 
364 aa  359  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  52.57 
 
 
366 aa  350  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  49.43 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  47.29 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  53.39 
 
 
370 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  46.59 
 
 
360 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  44.55 
 
 
347 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  43.71 
 
 
346 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  45.58 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  44.01 
 
 
347 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  40.83 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  39.22 
 
 
346 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  34.7 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  29.26 
 
 
477 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  31.19 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  25.7 
 
 
498 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  31.58 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  25.07 
 
 
535 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  29.23 
 
 
517 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  24.68 
 
 
573 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  30.37 
 
 
364 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  29.08 
 
 
469 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  31.21 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.62 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  29.15 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  26.51 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  22.62 
 
 
545 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  29.94 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  25.83 
 
 
357 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  30.09 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  26.52 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  26.52 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  28.23 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  26 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  25.08 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.38 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  28.18 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  27.78 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  26.14 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  26.12 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  26.12 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  28.96 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  28.63 
 
 
760 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  27.49 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  27.95 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  29.04 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  25.71 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  28 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  28 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  28 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  24.68 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  28.46 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  28.16 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  26.14 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  24.37 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  37.14 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  26.4 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  38.36 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  24.32 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  24.61 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  26.2 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  25.98 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  26.78 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  26.25 
 
 
400 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  25.51 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  28.4 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  39.73 
 
 
390 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  24.8 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  28.51 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  34.44 
 
 
415 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  34.83 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  32.58 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  27.48 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  44.12 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  39.13 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  24.67 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  25.61 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  22.93 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  24.73 
 
 
381 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  30.53 
 
 
413 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.64 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  29.41 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  32.05 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  23.67 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  24.2 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>